黑潮之上第三章的多个Boss战需要玩家针对其高单体伤害的特性进行专门的队伍构建与卡牌配置。应对本章Boss的通用思路是，队伍前排应配备能够提供嘲讽与无力效果的角色以保护后排，辅助角色需携带足够的单体护盾与回血卡牌，而输出角色则强烈建议选择艾尔莎，因其大招能快速提升Boss的深渊时钟层数，有效阻止Boss回血及获得伤害增幅，从而稳定战局。
首个Boss科罗塞尔的攻击模式为单体攻击，且其穿刺层数会战斗回合的推进而不断增加。挑战时需要携带较多的单体护盾与回血卡牌以确保队伍生存，同时必须配备单体输出能力极强的角色，力求快速击杀。艾尔莎在该战斗中表现突出，其大招不仅能克制Boss回血，还能压制其伤害加成。
面对Boss威沛时，需注意其极高的单体伤害以及会向玩家抽牌堆塞入污浊齿痕的机制。队伍应配置防御较高的角色和可靠的治疗，若拥有嘲讽类技能牌的坦克角色则更为稳妥。战斗中若抽到污浊齿痕，务必及时打出，避免因负面效果累积而导致减员。
Boss巴拉姆拥有禁忌知识机制，玩家每使用一张非攻击牌，就会将一张禁忌知识置入弃牌堆。为此，应尽量让输出角色多使用攻击牌，以减少禁忌知识的产生。由于其伤害同样是单体类型，前排携带如一骑当千等嘲讽牌，配合希娅的持续护盾与治疗，能有效维持战线。
应对Boss比克卢时，需留意其施加的分解状态，该状态会在回合结束时造成精神伤害，但玩家恢复生命可减少其层数。需要通过持续治疗来消除层数，例如携带希娅的持续治疗或痊愈等技能牌。针对其单体攻击，携带单体护盾与治疗卡牌依然是核心防御手段。
队伍构成应注重坦克的嘲讽保护、辅助的定点治疗与护盾支援，以及输出的快速压制能力。合理利用艾尔莎的特性克制Boss增益，并善用希娅等角色的持续恢复效果，是平稳度过本章挑战的关键。
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